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亦称好氧菌.在有氧环境中生长繁殖,氧化有机物或无机物的产能代谢过程,以分子氧为最终电子受体,进行有氧呼吸.包括大多数细菌、放线菌和真菌.没有氧就根本不能生长的细菌,称作专性好氧细菌.有很多细菌是好氧细菌,特别是大多数化能自养细菌、醋酸菌、枯草杆菌（枯草芽孢杆菌）、结核菌、固氮菌等均为专性好氧细菌.此外,有一种在分压低于0.2标准大气压下也能够良好生长的细菌,称它为微好氧细菌. 好氧性细菌有共生固氮菌、自生固氮菌（Azotobacteria）、乳酸菌、肺炎双球菌（Diplococcuspneumoniae）、硫细菌（sulfur bacteria）等. 厌氧微生物绝大多数为细菌，很少数是放线菌，极少数是支原体，厌氧真菌尚见于个别的报道。厌氧微生物在自然界分布广泛。人类生活的环境和人体本身就生存有种类众多的厌氧微生物，它们与人类的关系密切。尤其近十多年来许多新技术和方法的应用，致使厌氧微生物学取得很大的进展，获得了丰硕的成果。发现了众多种类的厌氧微生物，它们在自然界不仅生存于一般的常温的无氧和少氧环境中，最近尚发现有生存于高温环境最适生长温度为100－103℃甚至有高达105℃的超嗜热专性厌氧细菌，亦发现有能生长在南极的嗜冷厌氧菌，尚发现有能在22－25%盐浓度中生长的专性厌氧发酵的嗜盐菌。
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