来自美国圣地亚哥的消息–Illumina公司（纳斯达克代码：ILMN）近期宣布，在全球最大、最全面的云计算环境BaseSpace中增加了几项新内容，并推出BaseSpace专业版和企业版，测序数据分析它们全面整合了实验室信息管理系统（LIMS）方案和先进的硬件基础设施升级。
“BaseSpace正在以惊人的速度发展，新用户同比增长超过75%，应用程序使用同比增长超过900%，”Illumina企业信息部高级副总裁兼总经理Sanjay Chikarmane谈道。“新的专业版和企业版以及硬件基础设施升级将带来业界最广泛、最先进的基因组学分析平台。客户将快速灵活地在云端管理他们的测序流程，降低硬件设施的成本，同时加快基础和转化研究，最终改善临床护理。”
BaseSpace是目前唯一一个整合了样品设置、仪器和测序运行的监控系统，同时支持大规模基因组数据的存储、分析和共享的基因组学平台。此分析平台目前正处理着全球4,000多台测序系统的数据，包括Illumina群体规模的测序系统，HiSeq XIllumina拓展全球最大的基因组分析平台，并加入开放源码促进会Ten，并通过60多个应用程序为超过3万名注册用户提供一键式的分析。
基因组学研究人员如今也能选择高级选项服务，它们经过优化，可提升用户体验，并提高测序实验室的效率。BaseSpace专业版将提供多用户访问和自动化的应用程序设置。BaseSpace企业版通过单个域、多用户和群组以及单点登录来增加安全性和便利性。企业版还可以选择与GenoLogics的LIMS方案整合，使高通量实验室的效率和生产力得以提高，GenoLogics在2015年8月被Illumina收购。
“领先的云计算基因组学实验室信息管理系统Clarity LIMS与领先的云计算分析和存储平台BaseSpace的整合是天作之合，”Illumina旗下GenoLogics的副总裁Michael Ball表示。“这两者的结合，为客户提供了从样品到答案的无缝方案。”
“我们一直对BaseSpace的灵活性印象深刻，它能处理所有Illumina平台的数据，包括HiSeq X系统。这种上传、存储和分析大规模基因组信息以及在云端实时共享的能力给我们的操作带来了巨大的好处，”Hudson Alpha生物技术研究所高通量基因组学服务实验室的主任Shawn Levy博士谈道。“BaseSpace的工具集、强大的硬件基础设施和多样的分析功能，让我们能够共享项目以及全世界范围多个项目数据的共享。”
BaseSpace还发布了其预置方案BaseSpace Onsite的更新。BaseSpace Onsite v2.1将支持Illumina一系列测序平台中的更多系统，MiSeqIllumina拓展全球最大的基因组分析平台，并加入开放源码促进会，NextSeqIllumina拓展全球最大的基因组分析平台，并加入开放源码促进会和HiSeq 2500/3000/4000。新版本通过25个应用程序和最近更新的BaseSpace平台提供更多的内置信息学分析软件。BaseSpace Onsite v2.1为那些尚未准备好在云端使用BaseSpace的用户提供了一键式的信息学，也提供自助的信息学分析和更快的周转时间，来增强生物信息学团队的能力。
尽管在BaseSpace平台上增加了功能，但Illumina还继续向开放源码社区作出承诺，根据GPLv3许可证提供二次分析软件，让用户能够运行、分享和修改软件。目前，此许可协议下的基因组学软件包括Isaac Aligner和Manta Structural variant caller。其他基因组学分析工具也将很快发布，包括研究变异检出集合的Starlingsmall variant caller、Strelka somatic variant caller、Canvascopy number caller以及Haplotype Compare。
BaseSpace当前的服务将继续为客户免费提供1 TB的云存储。BaseSpace专业版和企业版将带来生物信息学的支持，并在2016年1月推出。如欲了解更多信息，请访问BaseSpace博客。
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